Trường Trung học cơ sở (THCS) và Trung học phổ thông (THPT) là loại hình trường công lập trong hệ thống giáo dục quốc dân. Hiện nay, trên địa bàn Thị trấn huyện Cô Tô có 02 trường là trường THCS Thị trấn Cô Tô và trường THPT Cô Tô. Cơ sở vật chất của trường THCS thị trấn hiện nay đã xuống cấp, còn thiếu phòng học bộ môn, phòng hỗ trợ học tập, khu sân chơi thể dục thể thao chưa đáp ứng yêu cầu.
Căn cứ các văn bản chỉ đạo của Trung ương và của tỉnh Quảng Ninh về việc tinh giảm đơn vị sự nghiệp công lập gắn với tinh giản biên chế, chủ trương của tỉnh Quảng Ninh về việc có phương án sáp nhập trường THCS và trường THPT ở những nơi có đủ điều kiện để thực hiện sắp xếp tinh gọn đơn vị sự nghiệp công lập, xây dựng tại mỗi huyện ít nhất 01 một trường phổ thông công lập theo tiêu chí chất lượng cao ở cấp học giáo dục phổ thông nhằm đáp ứng yêu cầu nâng cao chất lượng giáo dục, đào tạo nguồn nhân lực chất lượng phục vụ cho xây dựng và phát triển kinh tế - xã hội địa phương là chủ trương đúng đắn, phù hợp, đáp ứng nguyện vọng và nhu cầu mong muốn của nhân dân.
Hiện tại huyện Cô Tô có dân số ít, chủ trương khong tăng dân số cơ học, do vậy việc tăng số học sinh, số lớp hàng năm chậm. Do đó việc sáp nhập nhằm tận dụng cơ sở vật chất dùng chung, tránh lãng phí là cần thiết.
Theo quy hoạch chung xâ dựng huyện Cô Tô hiện nay, theo Quyết định số 3898/QĐ-UBND của UBND tỉnh thì trường THPT Cô Tô hiện nay thuộc quy hoạch sân bay, do vậy cần bố trí quỹ đất mới để chuyển trường khi đủ điều kiện.
Vì vậy, để triển khai bổ sung cơ sở vật chất cho cả 2 trường học tại địa bàn thị trấn huyện Cô Tô thì phương án sáp nhập Trường THCS Thị trấn Cô Tô vào Trường THPT Cô Tô thành Trường THCS&THPT Cô Tô, từ đó xây dựng và triển khai dự án đầu tư trường THCS&THPT Cô Tô đáp ứng kế hoạch phát triển giáo dục, đảm bảo tiêu chuẩn cơ sở vật chất quy định tại Thông tư 13/2020/TT-BGDĐT, ngày 26/5/2020 của Bộ Giáo dục và Đào tạo ban hành Quy định tiêu chuẩn cơ sở vật chất các trường mầm non, tiểu học, trung học cơ sở, trung học phổ thông và trường phổ thông có nhiều cấp học theo tiêu chí chất lượng cao, nhằm nâng cao chất lượng giáo dục cấp phổ thông trên địa bàn.